Fluorescencija in situ hibridizacije
Fluorescentna in situ hibridizacija (FISH) jedna je od nekoliko tehnika koja se koristi za traženje DNK stanice, tražeći prisutnost ili odsutnost specifičnih gena ili dijelova gena.
Mnoge različite vrste raka povezane su s poznatim genetskim abnormalnostima. Genetski, mi ne govorimo samo o nasljeđivanju. Tijekom života, stanice mogu pogriješiti kad se podijele i rastu.
Mutacije u DNA koja su povezana s rakom mogu se akumulirati u ovim stanicama.
Kako FISH radi?
FISH je tehnika koja koristi fluorescentne sonde za otkrivanje specifičnih gena ili dijelova gena (DNA sekvence). Medicinski centar laboratorija i onkolozi koriste FISH za procjenu pacijenata koji imaju rak, a ponekad i za praćenje pacijenta koji je već dijagnosticiran i liječen od raka.
FISH se može vršiti pomoću različitih tipova uzoraka ovisno o mjestu i vrsti raka koji se sumnjiči: Tumorske stanice dobivene iz periferne krvi, iz biopsije koštane srži ili iz biopsije limfnih čvorova i formalin fiksiranog parafinskog tkiva (to se odnosi na uzorak tkiva koji se prerađuje u laboratoriju i ugrađen u vrstu voska, čime se čvršću, tako da se može rezati u tanke dijelove i montirati za gledanje pod mikroskopom).
Što znače slova?
"H" u FISH-u odnosi se na hibridizaciju.
U molekularnoj hibridizaciji, označena DNA ili RNA sekvenca se koristi kao sonda - vizualizirati crvenu Lego ciglu, ako to želite. Sonda se koristi za pronalaženje protupješačkog Lego cigle, ili DNA sekvence, u biološkom uzorku.
DNA u vašem uzorku je poput hrpe Lego cigle, a većina cigle u tim gomilama neće odgovarati našoj crvenoj sondi.
A sve vaše cigle su uredno organizirane u 23 parove ciglenih pilota - svaka hrpa je jedan od vaših uparenih homolognih kromosoma, više ili manje. Za razliku od Lego cigle, naša crvena Lego sonda je poput snažnog magneta i pronađe njegovu utakmicu, a da ne treba razbijati gomile.
"F" se odnosi na fluorescenciju. Naša crvena sonda može se izgubiti u hrpe cigle, tako da je obilježena boji fluorescentna boja tako da će sjaj. Kada pronađe svoje podudaranje između 23 parova, fluorescentna oznaka otkriva njegovu lokaciju. Sada možete vidjeti kako istraživači i kliničari mogu koristiti FISH kako bi pomogli identificirati gdje (koja hrpa, ili koji kromosom) određeni gen nalazi se za određenu osobu.
"I" i "S" stoje za in situ . To se odnosi na činjenicu da naša crvena Lego cigla traži svoje podudaranje unutar uzorka koji ste dali .
Što je s određenim rakom krvi?
FISH i drugi postupci hibridizacije in situ koriste se za dijagnosticiranje različitih kromosomskih abnormalnosti - promjene u genetskom materijalu, promjene u kromosomima, uključujući sljedeće:
Brisanje - dio kromosoma je nestalo
Translokacija - dio jednog kromosoma se razgrađuje i drži se na drugom kromosomu
Inverzija - dio kromosoma se prekida i ponovno unese natrag, ali obrnutim redoslijedom
Umnožavanje - dio kromosoma prisutan je u previše kopija unutar ćelije
Svaka vrsta raka može imati svoj skup kromosomskih promjena i relevantnih sondi. FISH ne samo da pomaže prepoznati početne genetske promjene u procesu bolesti kao što je rak, ali se također može koristiti za praćenje odgovora na terapiju i remisiju bolesti.
Genetske promjene koje otkriva FISH ponekad nude dodatne informacije o tome kako se rak pojedinca vjerojatno ponaša, na temelju onoga što se u prošlosti uočilo kod ljudi s istom vrstom raka i sličnim genetskim promjenama. Ponekad se FISH upotrebljava nakon što je već postavljena dijagnoza, kako bi se prikupile dodatne informacije koje bi mogle pomoći u predviđanju ishodu pacijenta ili najboljem liječenju.
FISH može identificirati kromosomske abnormalnosti u leukemijama , uključujući kroničnu limfocitnu leukemiju (CLL). Za kroničnu limfocitnu leukemiju / mali limfocitni limfom, FISH omogućuje pacijentima da saznaju svoju prognostičku kategoriju: dobar, srednji ili loš. U akutnoj limfoblastičnoj leukemiji (ALL), genetika leukemijskih stanica može vam reći o razini rizika od raka i pomoći u vođenju terapijskih odluka.
FISH ploče su također dostupne za limfom, multiplog mijeloma, proliferativne poremećaje plazme stanica i mijelodisplastični sindrom. U slučaju limfoma stanica plašta, na primjer, postoji translokacija koju FISH može detektirati nazvan GH / CCND1 t (11; 14) koji je često povezan s tim limfomom.
Zašto FISH?
Prednost FISH-a je da ne mora biti izvedena na stanicama koje se aktivno dijele. Citogenetski testovi obično traju oko tri tjedna, jer stanice raka moraju rasti u laboratorijskim posudama oko 2 tjedna prije nego što se mogu testirati. Nasuprot tome, rezultati FISH-a obično su dostupni iz laboratorija u roku od nekoliko dana.
> Izvori:
> CPT citogenetski test za rak.
> Fluorescencija in situ hibridizacije (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Fluorescencija in situ hibridizacije (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD, i sur. Smjernice za testiranje fluorescencije u situ hibridizaciji u hematološkim poremećajima. Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 2007., 9 (2): 134-143.