Saznajte više o soju vrste Paenibacillus VT 400
U ljeto 2016. godine, na godišnjem sastanku Američkog društva za mikrobiologiju, znanstvenici su se okupili da dijele i raspravljaju o nalazima vezanim za svijet bakterija i ljudsko zdravlje.
Među otkrićima, skupina je izvijestila o cijelom genomu, ili cjelovitom nizu gena, za bakteriju zvanu Paenibacillus vrsta soja VT 400 (PVT400). Ove bakterije bile su prethodno pronađene u slini dječjeg pacijenta s akutnom limfoblastičnom leukemijom (ALL).
Detaljne informacije iz ove i buduće studije pomoći će znanstvenicima da saznaju mogu li ove bakterije imati ulogu u ljudskoj bolesti, osobito kod osoba s akutnom leukemijom koja uzrokuje upalu pluća ili krvotok infekcije.
Pneumonija kod osoba s rakom
Pneumonija je vodeći uzrok smrti u bolesnika s rakom kod neutropenije, a posebno onih s akutnom leukemijom. Neutropenija je nizak broj neutrofila u krvi neutrofili su bijele krvne stanice koje su važne za pomaganje tijelu u borbi protiv infekcije .
Donja infekcija dišnih putova vrlo je česta kod bolesnika s rakom, s nekim izvješćima koja pokazuju da će 13 do 31 posto bolesnika s leukemijom koji primaju kemoterapiju i do 80 posto primatelja hepatopoetskih transplantiranih matičnih stanica imati najmanje jednu epizodu upale pluća.
Neutropenska upala pluća potencijalno su opasne po život opasne infekcije. U takvim scenarijima liječnici odmah započinju terapiju antibioticima, bez čekanja da laboratorijski rezultati potvrde i odrede vrstu bakterijske infekcije - jer je toliko važno započeti liječenje odjednom kako bi se smanjio rizik da će pacijent podlegnuti infekciji.
Zapravo, preventivna terapija se koristi u određenim okolnostima, što je detaljno opisano u nastavku.
Nedavni napredak u upravljanju neutropeničnom pneumonijom potiču nadu za bolje ishode. Više medicinskih društava izdalo je ažurirane smjernice za antibiotsku terapiju sumnje neutropenične upale pluća.
A moguće je da noviji agensi koji potiču odgovore tijela na infekciju mogu dodatno pojačati aktivnost antibiotika.
Fokusiranje na patogene kod pacijenata s neutropenom
Smjernice Američkog društva kliničke onkologije (ASCO) preporučuju da liječnici pokušaju spriječiti infekciju u ambulantu s dubokom neutropenijom, ali bez groznice. Preporučuje se antibakterijsko i antifungalno liječenje ako se očekuje da će neutrofili ostati ispod 100 μl tijekom više od sedam dana. Smjernica navodi da je poželjno sredstvo za antibakterijsku preventivnu terapiju oralni fluorokinolon, dok je za antifungalnu terapiju oralni triazol.
Pacijenti s neutropenom su osjetljivi na mnogo širi spektar patogena od njihovih kolega. Liječnicima može biti korisno razmotriti odakle dolazi bakterija u predviđanju koji će antibiotici vjerojatno biti otporni i stoga koje će strategije najvjerojatnije biti najučinkovitije.
Paenibacillus vrste
Prema tom cilju, znanstvenici su proučavali PVT400, nove bakterije izolirane iz pacijenta leukemije, članice Paenibacillus roda - obitelji štapića u obliku bakterijskih vrsta. Različite vrste unutar ove skupine su izolirane iz tla, vode, biljaka, mlijeka i drugih mjesta.
Međutim, vrste Paenibacillus nisu poznate kao uzročnici ljudske bolesti. .. dok su nedavna izvješća pokazala moguću uključenost tri različite vrste Paenibacillus u ljudske bolesti.
Nakon što je PVT 400 izoliran iz sline dječjeg pacijenta s akutnom limfoblastičnom leukemijom , rane su studije pokazale neku sličnost ovih izolata s amilolitikom, što se nalazi u larve hindgutu leta; Međutim, do danas je ipak istina da P. amylolyticus nije otkriven kod ljudi, a daljnja ispitivanja pokazala su razlike između soja-VT 400 bakterija pronađenih u pacijentu raka i ostalih P.
amilolitički sojevi.
Dakle, kada su istraživači proučavali cijeli genom VT 400, došlo je do brojnih zanimljivih otkrića. Imali su gene koji kodiraju mehanizme otpora kemoterapijskim lijekovima, poput tunicamycina i bleomicina. Također su pronašli gene za bakterijske pumpe povezane s rezistencijom na više lijekova, kao i gene koji kodiraju otpornost na antibiotike, uključujući vankomicin, fosmidomicin, tetraciklin kao i lijekovi slični penicilinu ili beta-laktami.
Autori ove studije genoma zabilježili su da potpuni slijed genoma Paenibacillus sp. soj VT 400 pomoći će odrediti ulogu Paenibacillus vrsta u ljudskim bolestima i pružiti uvid u sastav normalnih bakterija koje žive u bolesnika s rakom krvi.
izvori:
> Evans SE, Ost DE. Pneumonija u pacijentu s karcinomom neutropena. Curr Opin Pulm Med . 2015 21 (3): 260-271.
Rybakova D, Wetzlinger U, Müller H, i sur. Kompletna genomska sekvenca Paenibacillus polymyxa soja SB3-1, tvar koja se prenosi bakterijom s antagonističkim djelovanjem prema biljnim patogenima. Genom najavljuje . 2015 3 (2): e00052-15.
De Souza R, Sant'Anna FH, Ambrosini A, i sur. Genoma Pseudomonas sp. FeS53a, pretpostavljajući bakteriju koja potiče rast biljaka povezana s rižom koja se uzgaja u željeznim stresnim tlima. Genom najavljuje. 2015 (2): e00248-15. 10,1128 / genomeA.00248-15.
Spence R, Demchick P, Hornitzky M, et al. Nadzor novozelandskih pčelinjaka za Paenibacillus alvei. NZ Entomol . 2013 36: 82-86.
Kim KK, Lee KC, Yu H, i sur. Paenibacillus sputi sp. nov., izoliran iz sputuma pacijenta s plućnom bolesti. Int J Syst Evol Microbiol . 2010. godine; 60: 2371-2376.
Mulcahy N. Nova ASCO smjernica o neutropeniji i groznici. Medscape Medical News. 16. siječnja 2013. Dostupno na http://www.medscape.com/viewarticle/777736.
Cvjetovi CR, Seidenfeld J, Bow EJ, et al. Antimikrobna profilaksa i ambulantno liječenje vrućice i neutropenije u odraslih osoba liječenih malignošću: Američka udruga kliničke onkologije smjernica kliničke prakse . J Clin Oncol . 2013 31 (6): 794-810.